Hasta 1907, cuando el Instituto recibió la gran medalla de oro en el Congreso Internacional de Higiene y Demografía, en Berlín, su producción científica, publicada en las revistas mencionadas, era resultado del trabajo de jóvenes investigadores que nunca habían asistido a otro centro de investigación. Sólo después de ese evento, científicos de renombre como Stanislas von Prowazek, Gustav Giemsa y Max Hartmann expresaron su interés en trabajar en los laboratorios de Manguinhos, permaneciendo aquí por mucho tiempo colaborando en estudios sobre viruela, citología, suero antidiftérico, espiroquetosis, ciliados, amebas. , triconinfas, hemogregarinas y otros protozoos.

El impacto del premio del Instituto fue decisivo en otros aspectos. El proyecto que transformó el Instituto Federal de Sueroterapia en un "Instituto de Patología Experimental", inactivo durante mucho tiempo en el Congreso, fue rápidamente aprobado y sancionado por el Presidente Affonso Penna, como Decreto nº 1812, el 12 de diciembre de 1907. Al ser aprobado por el Gobierno del respectivo regimiento, el 19 de marzo de 1908, se adoptó oficialmente el nombre de "Instituto Oswaldo Cruz".

Inaugurada en 1908, el Curso de Aplicación fue la primera escuela de posgrado brasileña, una verdadera innovación en el panorama científico nacional. Allí enseñó y trabajó, durante dos años, en métodos de investigación y experimentación en microscopía, microbiología, inmunología, física y química biológica y parasitología sensu lato.

Fue así que destinado específicamente a la fabricación de suero y vacuna contra la peste y la campaña contra esta enfermedad endémica, el Instituto Soroterápico formó un pequeño grupo que rápidamente absorbió y amplió los conocimientos científicos y tecnológicos necesarios para el éxito de la empresa. Con este conocimiento, una estructura mediocre se limitaría a la productividad rutinaria, de gran utilidad social pero confinada a su propósito inmediato. Pero quiso la suerte que al frente de la empresa hubiera alguien dispuesto a comprender que este exitoso inicio científico y tecnológico podía ampliarse a otros campos de la patología nacional. Con un desarrollo científico acorde a los más altos estándares de la época, asociado a la transmisión de conocimientos a través del Curso de Aplicación y a la producción de diversos agentes profilácticos, terapéuticos y diagnósticos, ya en 1909 el Instituto Oswaldo Cruz había asumido, en secuencia inversa, las tareas que hoy caracterizan a la Universidad moderna: docencia, investigación y extensión. Y, para asegurar mejor la difusión de los conocimientos generados en sus laboratorios, puso en circulación a partir de 1909 las "Memorias del Instituto Oswaldo Cruz".