Produzir ciência e promover a saúde em benefício da sociedade e do fortalecimento do Sistema Único de Saúde (SUS), realizando pesquisa, ensino, desenvolvimento tecnológico, inovação, serviços de referência e de coleções biológicas.
Ser um Instituto público de excelência, estratégico para o Estado e para o SUS, reconhecido nacional e internacionalmente pela geração e divulgação de conhecimento e por suas ações, produtos e serviços em saúde pública.
1. Ciência e inovação em saúde como base do desenvolvimento socioeconômico ambientalmente sustentável
2. Compromisso com a democracia
3. Compromisso com o caráter público e estratégico de Estado da Fiocruz
4. Compromisso socioambiental
5. Compromisso com acessibilidade plena, segurança, saúde e bem-estar
6. Cooperação e integração
7. Criatividade e diversidade científica
8. Democratização e compartilhamento do conhecimento com a sociedade
9. Educação como processo emancipatório
10. Ética, integridade e transparência
11. Excelência científica e inovação como pilares da atuação institucional, reconhecendo a pesquisa básica como fundamental para a cadeia do conhecimento
12. Mobilização permanente para a redução das iniquidades nas condições de vida e de saúde
13. Preservação e recuperação do patrimônio e da memória
14. Respeito e valorização das pessoas em sua diversidade e compromisso com a inclusão e o enfrentamento a todas as formas de discriminações e violências
15. Respeito e valorização do serviço público
16. Valorização dos trabalhadores e alunos e compromisso com a equidade
